#bosdriesz1



#reactions
vAAsynt1:
 $pool = {1.0}aa1
  (bm*e1*kn1*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa1/kIa1))
vAAsynt10:
 $pool = {1.0}aa10
  (bm*e10*kn10*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa10/kIa10))
vAAsynt11:
 $pool = {1.0}aa11
  (bm*e11*kn11*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa11/kIa11))
vAAsynt12:
 $pool = {1.0}aa12
  (bm*e12*kn12*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa12/kIa12))
vAAsynt13:
 $pool = {1.0}aa13
  (bm*e13*kn13*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa13/kIa13))
vAAsynt14:
 $pool = {1.0}aa14
  (bm*e14*kn14*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa14/kIa14))
vAAsynt15:
 $pool = {1.0}aa15
  (bm*e15*kn15*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa15/kIa15))
vAAsynt16:
 $pool = {1.0}aa16
  (bm*e16*kn16*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa16/kIa16))
vAAsynt17:
 $pool = {1.0}aa17
  (bm*e17*kn17*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa17/kIa17))
vAAsynt18:
 $pool = {1.0}aa18
  (bm*e18*kn18*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa18/kIa18))
vAAsynt19:
 $pool = {1.0}aa19
  (bm*e19*kn19*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa19/kIa19))
vAAsynt2:
 $pool = {1.0}aa2
  (bm*e2*kn2*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa2/kIa2))
vAAsynt20:
 $pool = {1.0}aa20
  (bm*e20*kn20*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa20/kIa20))
vAAsynt3:
 $pool = {1.0}aa3
  (bm*e3*kn3*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa3/kIa3))
vAAsynt4:
 $pool = {1.0}aa4
  (bm*e4*kn4*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa4/kIa4))
vAAsynt5:
 $pool = {1.0}aa5
  (bm*e5*kn5*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa5/kIa5))
vAAsynt6:
 $pool = {1.0}aa6
  (bm*e6*kn6*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa6/kIa6))
vAAsynt7:
 $pool = {1.0}aa7
  (bm*e7*kn7*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa7/kIa7))
vAAsynt8:
 $pool = {1.0}aa8
  (bm*e8*kn8*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa8/kIa8))
vAAsynt9:
 $pool = {1.0}aa9
  (bm*e9*kn9*step*(1 - r/rmax))/(nAmet*(1 + aa9/kIa9))
vRelA:
 $pool = {1.0}ppGpp
  vSpoTSynt + (kRelA*RelAtot)/(1 + (kDRelA*(0.05*kapparta*(kappart + tau1*r - taa1)*taa10*taa11*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa1*(0.05*kapparta*(kappart + tau10*r - taa10)*taa11*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa10*(0.05*kapparta*(kappart + tau11*r - taa11)*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa11*(0.05*kapparta*(kappart + tau12*r - taa12)*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa12*(0.05*kapparta*(kappart + tau13*r - taa13)*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa13*(0.05*kapparta*(kappart + tau14*r - taa14)*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa14*(0.05*kapparta*(kappart + tau15*r - taa15)*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa15*(0.05*kapparta*(kappart + tau16*r - taa16)*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa16*(0.05*kapparta*(kappart + tau17*r - taa17)*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa17*(0.05*kapparta*(kappart + tau18*r - taa18)*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa18*(0.05*kapparta*(kappart + tau19*r - taa19)*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa19*(0.05*kapparta*(kappart + tau2*r - taa2)*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa2*(0.05*kapparta*(kappart + tau20*r - taa20)*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa20*(0.05*kapparta*(kappart + tau3*r - taa3)*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa3*(0.05*kapparta*(kappart + tau4*r - taa4)*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa4*(0.05*kapparta*(kappart + tau5*r - taa5)*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa5*(0.05*kapparta*(kappart + tau6*r - taa6)*taa7*taa8*taa9 + taa6*(0.05*kapparta*(kappart + tau7*r - taa7)*taa8*taa9 + taa7*(0.05*kapparta*(kappart + tau8*r - taa8)*taa9 + taa8*(0.05*kapparta*(kappart + tau9*r - taa9) + kappart*taa9)))))))))))))))))))))/(kapparta*r*(0.05*(tau1*r - taa1)*taa10*taa11*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa1*(0.05*(tau10*r - taa10)*taa11*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa10*(0.05*(tau11*r - taa11)*taa12*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa11*(0.05*(tau12*r - taa12)*taa13*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa12*(0.05*(tau13*r - taa13)*taa14*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa13*(0.05*(tau14*r - taa14)*taa15*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa14*(0.05*(tau15*r - taa15)*taa16*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa15*(0.05*(tau16*r - taa16)*taa17*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa16*(0.05*(tau17*r - taa17)*taa18*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa17*(0.05*(tau18*r - taa18)*taa19*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa18*(0.05*(tau19*r - taa19)*taa2*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa19*(0.05*(tau2*r - taa2)*taa20*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa2*(0.05*(tau20*r - taa20)*taa3*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa20*(0.05*(tau3*r - taa3)*taa4*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa3*(0.05*(tau4*r - taa4)*taa5*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa4*(0.05*(tau5*r - taa5)*taa6*taa7*taa8*taa9 + taa5*(0.05*(tau6*r - taa6)*taa7*taa8*taa9 + taa6*(0.05*taa7*taa8*(tau9*r - taa9) + 0.05*taa7*(tau8*r - taa8)*taa9 + 0.05*(tau7*r - taa7)*taa8*taa9))))))))))))))))))))
vSpoT:
 {1.0}ppGpp = $pool
  kSpoTdeg*ppGpp
vbiomass:
 {0.05}taa1 + {0.05}taa10 + {0.05}taa11 + {0.05}taa12 + {0.05}taa13 + {0.05}taa14 + {0.05}taa15 + {0.05}taa16 + {0.05}taa17 + {0.05}taa18 + {0.05}taa19 + {0.05}taa2 + {0.05}taa20 + {0.05}taa3 + {0.05}taa4 + {0.05}taa5 + {0.05}taa6 + {0.05}taa7 + {0.05}taa8 + {0.05}taa9 = $pool
  (krib*r)/(1 + (0.05*kapparta*(kappart + tau1*r - taa1))/(kappart*taa1) + (0.05*kapparta*(kappart + tau10*r - taa10))/(kappart*taa10) + (0.05*kapparta)/taa11 + (0.05*kapparta*(tau11*r - taa11))/(kappart*taa11) + (0.05*kapparta)/taa12 + (0.05*kapparta*(tau12*r - taa12))/(kappart*taa12) + (0.05*kapparta)/taa13 + (0.05*kapparta*(tau13*r - taa13))/(kappart*taa13) + (0.05*kapparta)/taa14 + (0.05*kapparta*(tau14*r - taa14))/(kappart*taa14) + (0.05*kapparta)/taa15 + (0.05*kapparta*(tau15*r - taa15))/(kappart*taa15) + (0.05*kapparta)/taa16 + (0.05*kapparta*(tau16*r - taa16))/(kappart*taa16) + (0.05*kapparta)/taa17 + (0.05*kapparta*(tau17*r - taa17))/(kappart*taa17) + (0.05*kapparta)/taa18 + (0.05*kapparta*(tau18*r - taa18))/(kappart*taa18) + (0.05*kapparta)/taa19 + (0.05*kapparta*(tau19*r - taa19))/(kappart*taa19) + (0.05*kapparta)/taa2 + (0.05*kapparta*(tau2*r - taa2))/(kappart*taa2) + (0.05*kapparta)/taa20 + (0.05*kapparta*(tau20*r - taa20))/(kappart*taa20) + (0.05*kapparta)/taa3 + (0.05*kapparta*(tau3*r - taa3))/(kappart*taa3) + (0.05*kapparta)/taa4 + (0.05*kapparta*(tau4*r - taa4))/(kappart*taa4) + (0.05*kapparta)/taa5 + (0.05*kapparta*(tau5*r - taa5))/(kappart*taa5) + (0.05*kapparta)/taa6 + (0.05*kapparta*(tau6*r - taa6))/(kappart*taa6) + (0.05*kapparta)/taa7 + (0.05*kapparta*(tau7*r - taa7))/(kappart*taa7) + (0.05*kapparta)/taa8 + (0.05*kapparta*(tau8*r - taa8))/(kappart*taa8) + (0.05*kapparta)/taa9 + (0.05*kapparta*(tau9*r - taa9))/(kappart*taa9))
vrdilution:
 {1.0}r = $pool
  (krib*r**2)/(bm*(1 + (0.05*kapparta*(kappart + tau1*r - taa1))/(kappart*taa1) + (0.05*kapparta*(kappart + tau10*r - taa10))/(kappart*taa10) + (0.05*kapparta)/taa11 + (0.05*kapparta*(tau11*r - taa11))/(kappart*taa11) + (0.05*kapparta)/taa12 + (0.05*kapparta*(tau12*r - taa12))/(kappart*taa12) + (0.05*kapparta)/taa13 + (0.05*kapparta*(tau13*r - taa13))/(kappart*taa13) + (0.05*kapparta)/taa14 + (0.05*kapparta*(tau14*r - taa14))/(kappart*taa14) + (0.05*kapparta)/taa15 + (0.05*kapparta*(tau15*r - taa15))/(kappart*taa15) + (0.05*kapparta)/taa16 + (0.05*kapparta*(tau16*r - taa16))/(kappart*taa16) + (0.05*kapparta)/taa17 + (0.05*kapparta*(tau17*r - taa17))/(kappart*taa17) + (0.05*kapparta)/taa18 + (0.05*kapparta*(tau18*r - taa18))/(kappart*taa18) + (0.05*kapparta)/taa19 + (0.05*kapparta*(tau19*r - taa19))/(kappart*taa19) + (0.05*kapparta)/taa2 + (0.05*kapparta*(tau2*r - taa2))/(kappart*taa2) + (0.05*kapparta)/taa20 + (0.05*kapparta*(tau20*r - taa20))/(kappart*taa20) + (0.05*kapparta)/taa3 + (0.05*kapparta*(tau3*r - taa3))/(kappart*taa3) + (0.05*kapparta)/taa4 + (0.05*kapparta*(tau4*r - taa4))/(kappart*taa4) + (0.05*kapparta)/taa5 + (0.05*kapparta*(tau5*r - taa5))/(kappart*taa5) + (0.05*kapparta)/taa6 + (0.05*kapparta*(tau6*r - taa6))/(kappart*taa6) + (0.05*kapparta)/taa7 + (0.05*kapparta*(tau7*r - taa7))/(kappart*taa7) + (0.05*kapparta)/taa8 + (0.05*kapparta*(tau8*r - taa8))/(kappart*taa8) + (0.05*kapparta)/taa9 + (0.05*kapparta*(tau9*r - taa9))/(kappart*taa9)))
vrsynt:
 $pool = {1.0}r
  min((0.000666666666666667*rnapF*vInitMax)/((kMrrn + rnapF)*(1 + (ppGpp/kIppGpp)**nppGpp)), (gammamax*krib*r)/(nARib*(1 + (0.05*kapparta*(kappart + tau1*r - taa1))/(kappart*taa1) + (0.05*kapparta*(kappart + tau10*r - taa10))/(kappart*taa10) + (0.05*kapparta)/taa11 + (0.05*kapparta*(tau11*r - taa11))/(kappart*taa11) + (0.05*kapparta)/taa12 + (0.05*kapparta*(tau12*r - taa12))/(kappart*taa12) + (0.05*kapparta)/taa13 + (0.05*kapparta*(tau13*r - taa13))/(kappart*taa13) + (0.05*kapparta)/taa14 + (0.05*kapparta*(tau14*r - taa14))/(kappart*taa14) + (0.05*kapparta)/taa15 + (0.05*kapparta*(tau15*r - taa15))/(kappart*taa15) + (0.05*kapparta)/taa16 + (0.05*kapparta*(tau16*r - taa16))/(kappart*taa16) + (0.05*kapparta)/taa17 + (0.05*kapparta*(tau17*r - taa17))/(kappart*taa17) + (0.05*kapparta)/taa18 + (0.05*kapparta*(tau18*r - taa18))/(kappart*taa18) + (0.05*kapparta)/taa19 + (0.05*kapparta*(tau19*r - taa19))/(kappart*taa19) + (0.05*kapparta)/taa2 + (0.05*kapparta*(tau2*r - taa2))/(kappart*taa2) + (0.05*kapparta)/taa20 + (0.05*kapparta*(tau20*r - taa20))/(kappart*taa20) + (0.05*kapparta)/taa3 + (0.05*kapparta*(tau3*r - taa3))/(kappart*taa3) + (0.05*kapparta)/taa4 + (0.05*kapparta*(tau4*r - taa4))/(kappart*taa4) + (0.05*kapparta)/taa5 + (0.05*kapparta*(tau5*r - taa5))/(kappart*taa5) + (0.05*kapparta)/taa6 + (0.05*kapparta*(tau6*r - taa6))/(kappart*taa6) + (0.05*kapparta)/taa7 + (0.05*kapparta*(tau7*r - taa7))/(kappart*taa7) + (0.05*kapparta)/taa8 + (0.05*kapparta*(tau8*r - taa8))/(kappart*taa8) + (0.05*kapparta)/taa9 + (0.05*kapparta*(tau9*r - taa9))/(kappart*taa9))))
vtRNAchar1:
 {1.0}aa1 = {1.0}taa1
  (ks1*sTot1*aa1*(tau1*r - taa1))/(kMaa1*kMtf1*(aa1/kMaa1 + (tau1*r - taa1)/kMtf1 + (aa1*(tau1*r - taa1))/(kMaa1*kMtf1)))
vtRNAchar10:
 {1.0}aa10 = {1.0}taa10
  (ks10*sTot10*aa10*(tau10*r - taa10))/(kMaa10*kMtf10*(aa10/kMaa10 + (tau10*r - taa10)/kMtf10 + (aa10*(tau10*r - taa10))/(kMaa10*kMtf10)))
vtRNAchar11:
 {1.0}aa11 = {1.0}taa11
  (ks11*sTot11*aa11*(tau11*r - taa11))/(kMaa11*kMtf11*(aa11/kMaa11 + (tau11*r - taa11)/kMtf11 + (aa11*(tau11*r - taa11))/(kMaa11*kMtf11)))
vtRNAchar12:
 {1.0}aa12 = {1.0}taa12
  (ks12*sTot12*aa12*(tau12*r - taa12))/(kMaa12*kMtf12*(aa12/kMaa12 + (tau12*r - taa12)/kMtf12 + (aa12*(tau12*r - taa12))/(kMaa12*kMtf12)))
vtRNAchar13:
 {1.0}aa13 = {1.0}taa13
  (ks13*sTot13*aa13*(tau13*r - taa13))/(kMaa13*kMtf13*(aa13/kMaa13 + (tau13*r - taa13)/kMtf13 + (aa13*(tau13*r - taa13))/(kMaa13*kMtf13)))
vtRNAchar14:
 {1.0}aa14 = {1.0}taa14
  (ks14*sTot14*aa14*(tau14*r - taa14))/(kMaa14*kMtf14*(aa14/kMaa14 + (tau14*r - taa14)/kMtf14 + (aa14*(tau14*r - taa14))/(kMaa14*kMtf14)))
vtRNAchar15:
 {1.0}aa15 = {1.0}taa15
  (ks15*sTot15*aa15*(tau15*r - taa15))/(kMaa15*kMtf15*(aa15/kMaa15 + (tau15*r - taa15)/kMtf15 + (aa15*(tau15*r - taa15))/(kMaa15*kMtf15)))
vtRNAchar16:
 {1.0}aa16 = {1.0}taa16
  (ks16*sTot16*aa16*(tau16*r - taa16))/(kMaa16*kMtf16*(aa16/kMaa16 + (tau16*r - taa16)/kMtf16 + (aa16*(tau16*r - taa16))/(kMaa16*kMtf16)))
vtRNAchar17:
 {1.0}aa17 = {1.0}taa17
  (ks17*sTot17*aa17*(tau17*r - taa17))/(kMaa17*kMtf17*(aa17/kMaa17 + (tau17*r - taa17)/kMtf17 + (aa17*(tau17*r - taa17))/(kMaa17*kMtf17)))
vtRNAchar18:
 {1.0}aa18 = {1.0}taa18
  (ks18*sTot18*aa18*(tau18*r - taa18))/(kMaa18*kMtf18*(aa18/kMaa18 + (tau18*r - taa18)/kMtf18 + (aa18*(tau18*r - taa18))/(kMaa18*kMtf18)))
vtRNAchar19:
 {1.0}aa19 = {1.0}taa19
  (ks19*sTot19*aa19*(tau19*r - taa19))/(kMaa19*kMtf19*(aa19/kMaa19 + (tau19*r - taa19)/kMtf19 + (aa19*(tau19*r - taa19))/(kMaa19*kMtf19)))
vtRNAchar2:
 {1.0}aa2 = {1.0}taa2
  (ks2*sTot2*aa2*(tau2*r - taa2))/(kMaa2*kMtf2*(aa2/kMaa2 + (tau2*r - taa2)/kMtf2 + (aa2*(tau2*r - taa2))/(kMaa2*kMtf2)))
vtRNAchar20:
 {1.0}aa20 = {1.0}taa20
  (ks20*sTot20*aa20*(tau20*r - taa20))/(kMaa20*kMtf20*(aa20/kMaa20 + (tau20*r - taa20)/kMtf20 + (aa20*(tau20*r - taa20))/(kMaa20*kMtf20)))
vtRNAchar3:
 {1.0}aa3 = {1.0}taa3
  (ks3*sTot3*aa3*(tau3*r - taa3))/(kMaa3*kMtf3*(aa3/kMaa3 + (tau3*r - taa3)/kMtf3 + (aa3*(tau3*r - taa3))/(kMaa3*kMtf3)))
vtRNAchar4:
 {1.0}aa4 = {1.0}taa4
  (ks4*sTot4*aa4*(tau4*r - taa4))/(kMaa4*kMtf4*(aa4/kMaa4 + (tau4*r - taa4)/kMtf4 + (aa4*(tau4*r - taa4))/(kMaa4*kMtf4)))
vtRNAchar5:
 {1.0}aa5 = {1.0}taa5
  (ks5*sTot5*aa5*(tau5*r - taa5))/(kMaa5*kMtf5*(aa5/kMaa5 + (tau5*r - taa5)/kMtf5 + (aa5*(tau5*r - taa5))/(kMaa5*kMtf5)))
vtRNAchar6:
 {1.0}aa6 = {1.0}taa6
  (ks6*sTot6*aa6*(tau6*r - taa6))/(kMaa6*kMtf6*(aa6/kMaa6 + (tau6*r - taa6)/kMtf6 + (aa6*(tau6*r - taa6))/(kMaa6*kMtf6)))
vtRNAchar7:
 {1.0}aa7 = {1.0}taa7
  (ks7*sTot7*aa7*(tau7*r - taa7))/(kMaa7*kMtf7*(aa7/kMaa7 + (tau7*r - taa7)/kMtf7 + (aa7*(tau7*r - taa7))/(kMaa7*kMtf7)))
vtRNAchar8:
 {1.0}aa8 = {1.0}taa8
  (ks8*sTot8*aa8*(tau8*r - taa8))/(kMaa8*kMtf8*(aa8/kMaa8 + (tau8*r - taa8)/kMtf8 + (aa8*(tau8*r - taa8))/(kMaa8*kMtf8)))
vtRNAchar9:
 {1.0}aa9 = {1.0}taa9
  (ks9*sTot9*aa9*(tau9*r - taa9))/(kMaa9*kMtf9*(aa9/kMaa9 + (tau9*r - taa9)/kMtf9 + (aa9*(tau9*r - taa9))/(kMaa9*kMtf9)))


#parameters
EXTERNAL = 1.0
RelAtot = 0.0666666666667
bm = 1000000.0
e1 = 0.05
e10 = 0.05
e11 = 0.05
e12 = 0.05
e13 = 0.05
e14 = 0.05
e15 = 0.05
e16 = 0.05
e17 = 0.05
e18 = 0.05
e19 = 0.05
e2 = 0.05
e20 = 0.05
e3 = 0.05
e4 = 0.05
e5 = 0.05
e6 = 0.05
e7 = 0.05
e8 = 0.05
e9 = 0.05
gammamax = 1.0
kDRelA = 0.26
kIa1 = 100.0
kIa10 = 100.0
kIa11 = 100.0
kIa12 = 100.0
kIa13 = 100.0
kIa14 = 100.0
kIa15 = 100.0
kIa16 = 100.0
kIa17 = 100.0
kIa18 = 100.0
kIa19 = 100.0
kIa2 = 100.0
kIa20 = 100.0
kIa3 = 100.0
kIa4 = 100.0
kIa5 = 100.0
kIa6 = 100.0
kIa7 = 100.0
kIa8 = 100.0
kIa9 = 100.0
kIppGpp = 1.0
kMaa1 = 100.0
kMaa10 = 100.0
kMaa11 = 100.0
kMaa12 = 100.0
kMaa13 = 100.0
kMaa14 = 100.0
kMaa15 = 100.0
kMaa16 = 100.0
kMaa17 = 100.0
kMaa18 = 100.0
kMaa19 = 100.0
kMaa2 = 100.0
kMaa20 = 100.0
kMaa3 = 100.0
kMaa4 = 100.0
kMaa5 = 100.0
kMaa6 = 100.0
kMaa7 = 100.0
kMaa8 = 100.0
kMaa9 = 100.0
kMrrn = 20.0
kMtf1 = 1.0
kMtf10 = 1.0
kMtf11 = 1.0
kMtf12 = 1.0
kMtf13 = 1.0
kMtf14 = 1.0
kMtf15 = 1.0
kMtf16 = 1.0
kMtf17 = 1.0
kMtf18 = 1.0
kMtf19 = 1.0
kMtf2 = 1.0
kMtf20 = 1.0
kMtf3 = 1.0
kMtf4 = 1.0
kMtf5 = 1.0
kMtf6 = 1.0
kMtf7 = 1.0
kMtf8 = 1.0
kMtf9 = 1.0
kRelA = 75.0
kSpoTdeg = 0.0231049060187
kappart = 500.0
kapparta = 1.0
kn1 = 0.176694097633
kn10 = 0.175155965973
kn11 = 0.218930812944
kn12 = 0.189250477437
kn13 = 0.182501157889
kn14 = 0.168797176257
kn15 = 0.17817281343
kn16 = 0.163557478413
kn17 = 0.240562151147
kn18 = 0.234708428287
kn19 = 0.23885732482
kn2 = 0.170472469931
kn20 = 0.192552580536
kn3 = 0.21501492449
kn4 = 0.160529780205
kn5 = 0.154007815603
kn6 = 0.232252087628
kn7 = 0.188971693283
kn8 = 0.202409099613
kn9 = 0.221447303291
krib = 20.0
ks1 = 100.0
ks10 = 100.0
ks11 = 100.0
ks12 = 100.0
ks13 = 100.0
ks14 = 100.0
ks15 = 100.0
ks16 = 100.0
ks17 = 100.0
ks18 = 100.0
ks19 = 100.0
ks2 = 100.0
ks20 = 100.0
ks3 = 100.0
ks4 = 100.0
ks5 = 100.0
ks6 = 100.0
ks7 = 100.0
ks8 = 100.0
ks9 = 100.0
nARib = 12307.35
nAmet = 300.0
nRRNRib = 4567.0
nppGpp = 1.0
rmax = 81.2522598285
rnapF = 1.0
sTot1 = 1.0
sTot10 = 1.0
sTot11 = 1.0
sTot12 = 1.0
sTot13 = 1.0
sTot14 = 1.0
sTot15 = 1.0
sTot16 = 1.0
sTot17 = 1.0
sTot18 = 1.0
sTot19 = 1.0
sTot2 = 1.0
sTot20 = 1.0
sTot3 = 1.0
sTot4 = 1.0
sTot5 = 1.0
sTot6 = 1.0
sTot7 = 1.0
sTot8 = 1.0
sTot9 = 1.0
step = 1.375
tau1 = 0.5
tau10 = 0.5
tau11 = 0.5
tau12 = 0.5
tau13 = 0.5
tau14 = 0.5
tau15 = 0.5
tau16 = 0.5
tau17 = 0.5
tau18 = 0.5
tau19 = 0.5
tau2 = 0.5
tau20 = 0.5
tau3 = 0.5
tau4 = 0.5
tau5 = 0.5
tau6 = 0.5
tau7 = 0.5
tau8 = 0.5
tau9 = 0.5
vInitMax = 2000.0
vSpoTSynt = 0.001
default = 1.0


#initial values
aa1 = 1.0
aa10 = 1.0
aa11 = 1.0
aa12 = 1.0
aa13 = 1.0
aa14 = 1.0
aa15 = 1.0
aa16 = 1.0
aa17 = 1.0
aa18 = 1.0
aa19 = 1.0
aa2 = 1.0
aa20 = 1.0
aa3 = 1.0
aa4 = 1.0
aa5 = 1.0
aa6 = 1.0
aa7 = 1.0
aa8 = 1.0
aa9 = 1.0
ppGpp = 1.0
r = 24.3757
taa1 = 7.3127
taa10 = 7.3127
taa11 = 7.3127
taa12 = 7.3127
taa13 = 7.3127
taa14 = 7.3127
taa15 = 7.3127
taa16 = 7.3127
taa17 = 7.3127
taa18 = 7.3127
taa19 = 7.3127
taa2 = 7.3127
taa20 = 7.3127
taa3 = 7.3127
taa4 = 7.3127
taa5 = 7.3127
taa6 = 7.3127
taa7 = 7.3127
taa8 = 7.3127
taa9 = 7.3127


#assignment rules